天然石英不純的因素主要包括晶格雜質、流體包裹體、礦物包裹體、晶間雜質和微米包裹體等。
 
石英中的礦物包裹體和熔融包裹體由于粒度極細，且被石英嚴密包裹，很難在不破壞石英晶體的條件下通過選冶方法除掉。

 
流體包裹體對高純石英的影響首先表現在流體包裹體中富含金屬離子，是影響石英純度的主要影響因素之一；其次流體包裹體在石英熔融過程中不會完全爆裂，其加熱產生的氣體在高粘度的石英熔體中很難排出，是石英玻璃制品產生氣泡缺陷的主要因素之一。
 
研究顯示，石英中流體包裹體含量與石英制品中氣泡缺陷呈正比關系。因此，石英中礦物包裹體、流體包裹體的含量是影響石英制品質量的主要因素之一。因此，要想判斷一個石英原礦能否生產高純石英砂，有必要通過工藝礦物學研究規定，判斷礦物包裹體、流體包裹體的含量等方面信息，初步判斷潛力樣品可行性。
 
高純石英提純工藝主要分為初步礦物分選和化學深度提純，色選、磁選、浮選等初步物理分選可去除幾乎所有以單體形式存在的礦物雜質，但物理分選并不能去除石英中的流體包裹體和晶格雜質，因此，制備高純石英必須進行化學深度提純。
 
化學深度提純中最核心的工藝是酸堿浸出，酸堿浸出以氫氟酸為主浸劑酸的混合酸浸應用最為廣泛。同時，由于雜質元素和流體包裹體的存在，高純石英的提純需利用界面硅氧鍵和金屬氧鍵的熱學性質差異，在晶型轉化點經高溫煅燒-急速水淬使包裹體爆裂、晶體產生裂紋，提高雜質去除率。